Poslední sezónu v krajském přeboru jsme zahájili na podzim roku 1988 v domácím prostředí s celkem Horní Suché. 350 platících diváků vidělo naši porážku 0:3 po poločase 0:1. Další utkání se nám nevyvedlo a prohráli jsme v Dolním Benešově stejným poměrem. I přes neúspěchy však těšil zájem fanoušků, kterých se vždy při utkání našeho celku sešlo v průměru 200.

Po podzimní části však naše situace nebyla nijak růžová, neboť jsme se nacházeli na předposledním místě pouze s devíti body před Vrbnem. V posledním podzimním utkání roku 1988 jsme hráli ve Vrbně, kde skoro za zimního počasí jsme prohráli vysoko 0:3. V dobré divácké kulise se neslo jarní utkání roku 1989, kdy jsme hostili Dolní Benešov, tehdy vedoucí celek soutěže. Před návštěvou více jak 1300 diváků jsme předvedli vynikající výkon a vyhráli 2:1, když naše branky dali Vratislav Šrám a Josef Kašný. O našem vítězství rozhodl druhý jmenovaný.

Konečná tabulka krajského přeboru v ročníku 1988-1989

1.	Dolní Benešov	23	3	4	69	:	22	49
2.	Zbrojovka Vsetín	14	6	10	53	:	40	34
3.	Horní Suchá	12	8	9	35	:	29	32
4.	Náměšť na Hané	12	7	11	54	:	41	31
5.	Vratimov	12	7	11	44	:	34	31
6.	Ostroj Frýdlant	12	7	11	44	:	41	31
7.	VTJ Hranice	11	8	10	51	:	38	30
8.	V. Meziříčí	11	7	12	43	:	43	29
9.	Karolinka	10	9	11	38	:	40	29
10.	ŽDB Bohumín B	12	4	14	41	:	56	28
11.	Nový Jičín	10	8	12	39	:	50	28
12.	Studénka	11	6	13	44	:	44	28
13.	Kobeřice	10	8	12	34	:	47	28
14.	Paskov	9	9	12	27	:	43	27
15.	MEZ Vsetín	10	6	14	35	:	38	26
16.	Vrbno	5	7	18	33	:	78	17

Do nižší soutěže sestupovaly celky Kobeřic, Paskova, MEZ Vsetín a Vrbna. Do vyšší soutěže postupovalo mužstvo Dolního Benešova, které vyhrálo soutěž s patnáctibodovým náskokem.

Poslední utkání v krajském přeboru jsme hráli v domácím prostředí s celkem MEZ Vsetín. Tomu šlo relativně jen o fotbalovou čest. Naši k jistému udržení potřebovali nutně vyhrát. Utkání se odehrávalo před návštěvou více jak 600 diváků. V poločase jsme vedli 2:1 brankami Teuera a Šráma. Ale fotbalový bůh nám tentokrát asi nepřál, přišlo vyrovnání a náš účet byl sečet. Umístili jsme se na 13. místě, ale to na záchranu bohužel nestačilo. I když jsme měli lepší skóre než Bohumín B, rozhodovala vzájemná utkání. Čtyři mužstva měla po posledním odehraném utkání soutěže krajského přeboru ročníku 1988-1989 stejný počet bodů, proto rozhodovala tabulka vzájemných zápasů.

Naše mužstvo tedy bylo na tom nejhůře a padalo do soutěže I. A třídy. Jedna z nejúspěšnějších kapitol historie kobeřické kopané se tak uzavřela.

Tabulka, která rozhodla o našem sestupu do nižší soutěže.

ŽD Bohumín B 3 1 2 9:9 7 bodů

Nový Jičín 2 2 2 13:10 6 bodů

Studénka 2 2 2 7:7 6 bodů

Kobeřice 2 1 3 7:10 5 bodů

Koncem roku 1989 se uskutečnil na našem hřišti finálový turnaj o Zlatý pohár Zemědělských novin. Po celou dobu vládla skvělá atmosféra, která byla zakončena celkovým vítězstvím domácího mužstva hrajícího pod hlavičkou JZD 9. květen Kravaře. V posledním utkání turnaje dokázalo remizovat s celkem JZD Kateřinky 0:0, což stačilo k vítězství a zisku Zlatého poháru.